Wellesberg war früher Zentralort einer Honschaft im Kirchspiel Uckerath. Sie hatte 1742 425 Einwohner in 68 Familien, 1791 497 Einwohner in 88 Familien. Zur Honschaft gehörten neben Wellesberg selbst die Weiler Wirsberg, Dahlhausen, Hermesmühle, Hanfmühle, Busch, Heide, Eulenberg und Büllesfeld.
Bis zum 1. August 1969 gehörte Wellesberg zur Gemeinde Uckerath. Im Rahmen der kommunalen Neugliederung des Raumes Bonn wurde Uckerath, damit auch der Ort Wellesberg, der damals neuen amtsfreien Gemeinde „Hennef (Sieg)“ zugeordnet.